Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf11bB4XVQ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms