Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Brpf1B2RRD7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brpf1B2RRD7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brpf1B2RRD7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms