Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brpf3B2KF05 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brpf3B2KF05 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf3B2KF05 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf3B2KF05 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms