Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms