Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prr29B1ARI9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr29B1ARI9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prr29B1ARI9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms