Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhox1B1APN4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rhox1B1APN4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rhox1B1APN4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms