Protein–RNA interactions for Protein: A2APA5

Fam209, 1700029J11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam209A2APA5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam209A2APA5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam209A2APA5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam209A2APA5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam209A2APA5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam209A2APA5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam209A2APA5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam209A2APA5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam209A2APA5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam209A2APA5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam209A2APA5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms