Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm5938A2AEN9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5938A2AEN9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms