Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc27A2A6Q5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdc27A2A6Q5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc27A2A6Q5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1066.3 ms