Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRF5

Gm20792, Predicted gene 28891, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20792A0A087WRF5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20792A0A087WRF5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20792A0A087WRF5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms