Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W5

Rbm6, RNA-binding motif protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm6S4R1W5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm6S4R1W5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm6S4R1W5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms