Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ5

Apip, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApipQ9WVQ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ApipQ9WVQ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ApipQ9WVQ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ApipQ9WVQ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms