Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme3Q9WV85 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme3Q9WV85 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme3Q9WV85 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms