Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sema6cQ9WTM3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sema6cQ9WTM3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms