Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cry2Q9R194 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cry2Q9R194 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms