Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod3Q9R0E1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod3Q9R0E1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms