Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc1Q9QZF2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc1Q9QZF2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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