Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcl11aQ9QYE3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11aQ9QYE3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms