Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm4Q9QXA5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm4Q9QXA5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms