Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dkk3Q9QUN9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dkk3Q9QUN9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dkk3Q9QUN9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms