Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Csnk1eQ9JMK2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Csnk1eQ9JMK2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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