Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnkpQ9JLV6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PnkpQ9JLV6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnkpQ9JLV6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms