Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col5a3Q9JLI2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col5a3Q9JLI2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms