Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod4Q9JLH8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmod4Q9JLH8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod4Q9JLH8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod4Q9JLH8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod4Q9JLH8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmod4Q9JLH8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod4Q9JLH8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod4Q9JLH8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod4Q9JLH8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod4Q9JLH8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod4Q9JLH8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod4Q9JLH8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmod4Q9JLH8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms