Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn5Q9JL35 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hmgn5Q9JL35 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms