Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc12a4Q9JIS8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc12a4Q9JIS8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc12a4Q9JIS8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc12a4Q9JIS8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc12a4Q9JIS8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc12a4Q9JIS8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc12a4Q9JIS8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc12a4Q9JIS8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc12a4Q9JIS8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc12a4Q9JIS8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc12a4Q9JIS8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a4Q9JIS8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms