Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl28Q9JIL2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms