Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Cldn19Q9ET38 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Cldn19Q9ET38 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Cldn19Q9ET38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Cldn19Q9ET38 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn19Q9ET38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Cldn19Q9ET38 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Cldn19Q9ET38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Cldn19Q9ET38 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Cldn19Q9ET38 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Cldn19Q9ET38 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Cldn19Q9ET38 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Cldn19Q9ET38 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Cldn19Q9ET38 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn19Q9ET38 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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