Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OtofQ9ESF1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtofQ9ESF1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms