Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfcp2Q9ERA0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfcp2Q9ERA0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms