Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SgshQ9EQ08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SgshQ9EQ08 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms