Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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Tlr1Q9EPQ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr1Q9EPQ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr1Q9EPQ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr1Q9EPQ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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