Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc46a3Q9DC26 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc46a3Q9DC26 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms