Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph3bQ9DA80 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms