Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SlirpQ9D8T7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms