Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Alkbh4Q9D8F1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms