Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl4Q9D8E6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl4Q9D8E6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms