Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med8Q9D7W5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med8Q9D7W5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med8Q9D7W5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med8Q9D7W5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med8Q9D7W5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med8Q9D7W5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms