Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab11fip1Q9D620 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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