Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D5Q8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D5Q8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D5Q8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D5Q8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D5Q8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D5Q8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D5Q8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D5Q8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D5Q8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms