Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf1dQ9D4V4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1dQ9D4V4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.8 ms