Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931423N10RikQ9D4J9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931423N10RikQ9D4J9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms