Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Efhd1Q9D4J1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efhd1Q9D4J1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms