Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChtopQ9CY57 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms