Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK4

Slc50a1, Sugar transporter SWEET1, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc50a1Q9CXK4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc50a1Q9CXK4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc50a1Q9CXK4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms