Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp23Q9CX11 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Utp23Q9CX11 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms