Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhobtb3Q9CTN4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms