Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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