Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mid1ip1Q9CQ20 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid1ip1Q9CQ20 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms