Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn6Q99PL6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn6Q99PL6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms